天津沿岸海水中创伤弧菌的PCR检测和定量

采用普通PCR方法和SYBR Green实时定量PCR方法,根据创伤弧菌16S rDNA和23S rDNA基因间隔序列(internal transcribed spacer,ITS)设计引物,对渤海湾天津沿岸海水中的创伤弧菌进行了定性和定量检测.8个样品采集自天津市汉沽区沿岸海水,采集时间分别为2008年7月、10月和2009年3月、5月.PCR检测结果表明,这些样品都能扩增出276 bp的ITS序列,这些序列和GenBank上的同源序列(DQ462478)的相似性为96%～98%.用SYBR Green实时定量PCR方法测定了8个海水样品,样品中创伤弧菌的浓度为7.12×10~3～8.40×10~5 个/L,表明天津沿岸海水存在严重的创伤弧菌污染.     

酚降解菌株的分离、鉴定和在含酚废水生物处理中的应用

从石油化工厂的活性污泥和废水混合物中分离到10个降解酚的细菌菌株,经16S rRNA基因序列分析,5个菌株(PD1、PD2、PD6、PD7和PD39)被鉴定为假单胞菌(Pseudomonas sp.),4个菌株(PD4、PD5、PD8和PD9)为不动杆菌(Acinetobacter sp.),1个菌株(PD3)为丛毛单胞菌(Comamonas sp.).对假单胞菌(Pseudomonas sp.)PD39菌株的酚降解特性、最适生长条件、降解底物的范围、儿茶酚1,2-双加氧酶(C12O)和儿茶酚2,3-双加氧酶(C23O)活性、含酚废水的生物处理等,进行了详细研究.结果表明,PD39菌株的最适生长和降解条件是,培养基的起始pH为7.0,培养温度为30℃,酚浓度为800 mg/L,对酚的最大降解浓度为1 200 mg/L.酚浓度为637 mg/L的工业废水经72 h处理酚的去除率达到99.96%.PD39菌株有很好的应用潜力来作含酚废水活性污泥处理系统的强化菌株.     

萘降解质粒pND6的分离和鉴定

从工业废水中分离的假单胞菌 (Pseudomonassp .)ND6菌株 ,能以萘为唯一碳源生长 ,使无机盐培养基(MM)中 2g/L的萘在 48h内降解 98% .该菌株含有一个 115kb的大质粒pND6 .DNA杂交实验表明 ,pND6质粒含有与恶臭假单胞菌 (P .putida)G7菌株的NAH7质粒同源的萘降解基因 .图 3表 1参 14     

降解除草剂阿特拉津的藤黄微球菌AD3菌株的分离、鉴定和降解特性研究

用富集培养法从农药厂的工业废水和污泥的混合物中分离到能够降解除草剂阿特拉津的AD3菌株,通过16SrRNA基因序列分析和Biolog细菌自动鉴定仪微量平板测定,该菌株被鉴定为藤黄微球菌(Micrococcusluteus).在以阿特拉津为唯一氮源(500μg·mL-1)的基本培养基中,AD3菌株能在48h内使阿特拉津降解97%以上.对AD3菌株和Pseudomonassp.ADP菌株的阿特拉津氯水解酶基因中间区的核苷酸序列和对应氨基酸序列进行比对结果表明,它们的核苷酸序列和氨基酸序列分别有5个位点和4个位点不同,核苷酸序列和氨基酸序列的类似性分别为99.1%和97.7%.     

渤海湾天津沿岸海水中甲肝病毒的检测和定量

甲肝病毒（hepatitis A virus, HAV）是能引起传染性甲型肝炎的单链RNA病毒.用常规RT-PCR（反转录PCR）和SYBR Green实时定量RT-PCR方法,根据甲肝病毒保守的VP1-VP2基因序列设计引物,对渤海湾天津沿岸海水中的甲肝病毒进行了检测和定量分析. 9个样品取自渤海湾天津塘沽以南沿岸海水,取样时间分别是2007年夏、秋、冬季和2008年春季. 海水样品先用小型超滤装置（Millipore Pellicon Mini TFF）或超滤离心管（Millipore Centricon Plus-70）浓缩,然后进行RT-PCR检测.结果表明,从9个海水样品中都能扩增出192 bp的HAV cDNA,这些cDNA的核苷酸序列与GenBank中的同源序列相似性为95%～100%. 用SYBR Green 实时定量RT-PCR检测了春季和冬季的6个海水样品,结果表明,海水中甲肝病毒的浓度范围为5.35×10⁶～4.51×10⁷ virus particles/L.     

分离假单胞菌大质粒的简便方法

本文介绍了一种分离假单胞菌大质粒的简便方法。用这种方法提取的质粒DNA样品,可直接用于琼脂糖凝胶电泳检查和限制性内切酶分析。     

黄杆菌ND3菌株的分离和降解萘的研究

从工业污水中分离出高效降解萘的菌株黄杆菌ＮＤ３,该菌株还能降解水杨酸,对翔基苯甲和苯乙酸,对氨苄青霉素和氯霉素具有抗性,含有一个大质粒。适合该菌株生长的最适培养条件被确定。在最适培养条件下,ＮＤ３菌株对萘的降解率达９８％以上。     

苯甲酸类化合物的微生物降解研究

用富集培养法从工业污水中分离到5个能以苯甲酸为唯一碳源和能源而生长的细苗菌株：不动杆菌（Acinetobactersp.）BJ1,无色杆菌（Achromobactersp.）BY1,假单胞苗（Pseudomonasspp.）SJ1、SY1和SH1、测定了这5个菌株的底物特异性和抗菌素抗性其中BJ1菌株含有1个大质粒和2个小质位在最适培养条件下BJ1菌株对苯甲酸的降解率达98％以上．     

硝基芳香烃降解菌株的分离、鉴定和应用

从被二硝基甲苯(DNT)和三硝基甲苯(TNT)污染的土壤中分离到5个高效降解硝基芳香烃类化合物的菌株TD1、TD2、TD3、TD4和TD5。16S rDNA序列分析表明,TD1、TD2、TD3和TD4属于节杆菌属(Arthrobacter),TD5属于不动杆菌属(Acinetobacter)。菌株复配试验表明,TD1、TD2、TD3、TD4和TD5的体积比例为2:2:2:1:1时对含有DNT和TNT的炸药废水的CODC r去除率最好。最佳复配的菌液投加到装有合适填料载体的生物反应器中用于处理炸药废水,运行47d后出水CODC r不超过200 mg/L,硝基苯类化合物的浓度在2 mg/L以下。     

2,4-二氯酚降解菌的分离及其特性

从３个不同地点采集的混合土壤中，分离到２株可利用２，４二氯酚为唯一碳源和能源的假单胞菌（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓｓｐ．）ＤＣＰ１和ＤＣＰ２．在此基础上，研究探索了菌株ＤＣＰ１降解２，４二氯酚的影响因素和降解过程以及其遗传特性．结果表明：菌株ＤＣＰ１可降解２，４二氯酚，并有氯离子、邻氯酚和醌积累；经检测该菌株中有一条迁移速率比ｐＵＣ１８小的质粒．